بررسی تنوع ژنتیکی جنسcrassostrea در سواحل بندر امام خمینی با روش تعیین توالی ژن ۱۶s rrna

Authors

زینب احمدی

دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر حسین ذوالقرنین

دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر_عضو هیأت علمی بیتا ارچنگی

دانشگاه علو.م و فنون دریایی خرمشهر_عضو هیأت علمی ابراهیم رجب زاده

دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر_عضو هیأت علمی

abstract

16s rrna یکی از اجزای بخش بزرگ ریبوزومی می باشد که بوسیله ی ژنوم میتوکندریایی کد می شود و به طور گسترده ای در مطالعات فیلوژنتیکی مربوط به گونه های نزدیک و به خصوص گونه های مربوط به crassostrea مورد استفاده قرار می گیرد. پلی مورفیسم توالی نوکلئوتیدی مربوط به ژن 16s rrna ژنوم میتوکندریایی اویستر خلیج فارس (crassostrea sp.)، در 30 نمونه اویستر جمع آوری شده از بندر امام خمینی مورد بررسی قرار گرفت. واکنش زنجیره ای pcr از طریق یک جفت آغازگر برای تمام نمونه ها انجام و سپس محصولات pcr، توالی یابی اتوماتیک شدند. سپس اطلاعات بدست آمده از طریق برنامه ها و نرم افزارها مورد آنالیز قرار گرفتند. برای ژن مورد بررسی تنها 2 موتاسیون مشاهده شد و تنوع نوکلئوتیدی (pi) 00061/0 محاسبه گردید. در میان 30 نمونه، تعداد 3 هاپلوتیپ شناسایی شد میانگین تنوع هاپلوتیپی (hd) 195/0 محاسبه گردید. هاپلوتیپ های بدست آمده از تحقیق حاضر برای اولین بار در بانک ژنی ثبت گردیدند. رسم درخت های فیلوژنی حاصل از داده های توالی یابی ژن مورد نظر هیچ جدائی مشخصی را برای نمونه های مورد مطالعه در بندر امام خمینی فراهم نکرد. نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که تمایز توالی پائینی در جمعیت مورد بررسی در بندر امام خمینی وجود دارد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

بررسی تنوع ژنتیکی جنسCrassostrea در سواحل بندر امام خمینی با روش تعیین توالی ژن 16S rRNA

16S rRNA یکی از اجزای بخش بزرگ ریبوزومی می باشد که بوسیله‌ی ژنوم میتوکندریایی کد می‌شود و به طور گسترده‌ای در مطالعات فیلوژنتیکی مربوط به گونه‌های نزدیک و به خصوص گونه های مربوط به Crassostrea مورد استفاده قرار می‌گیرد. پلی مورفیسم توالی نوکلئوتیدی مربوط به ژن 16S rRNA ژنوم میتوکندریایی اویستر خلیج فارس (Crassostrea sp.)، در 30 نمونه اویستر جمع آوری شده از بندر امام خمینی مورد بررسی قرار گرفت. ...

full text

تنوع ژنتیکی میگوی سرتیز Metapenaeus affinis در خلیج فارس بر اساس توالی ژن میتوکندریایی 16S rRNA

میگوی سرتیز رتبه دوم میزان صید میگوی را در استان هرمزگان داشته و در چرخه صید و صیادی خلیج فارس اهمیت زیادی دارد. از این رو، بررسی تنوع ژنتیکی این گونه مهم مد نظر قرار گرفت. نمونه‌های میگو از سه منطقه بندرعباس، بوشهر و آبادان جمع‌آوری شدند و برای توالی‌یابی ژن میتوکندریایی 16S rRNA مورد بررسی قرار گرفتند. بهینه‌سازی واکنش PCR جهت تکثیر ژن انجام شد. نتایج توالی‌یابی ژن 16S rRNA که شامل 486 باز هم...

full text

بررسی ساختار ژنتیکی گونه ی crassostrea sp. در سواحل شمالی خلیج فارس با روش تعیین توالی ژن 16s rrna

جهت بررسی و مقایسه ی تنوع ژنتیکی اویستر خلیج فارس که قبل از این مطالعه به اویستر crassostrea gigas معروف بود، مجموعاً 30 نمونه از بندر امام خمینی و بندر عباس در آبان ماه 90 جمع آوری گردید. استخراج dna به روش ctab انجام گردید. آغازگرها از روی ژن 16s rrna ثبت شده در بانک ژنی، انتخاب گردید. واکنش زنجیره ای pcr برای تمام نمونه ها انجام و سپس محصولات pcr، توالی یابی اتوماتیک شدند. پس از تعیین توالی ا...

گزارش گونه‏های نوکاردیای جدا‏سازی شده ازخاک، توسط تعیین توالی ژن ۱۶s rrna، اصفهان، ایران

مقدمه: جنس نوکاردیا جزو اکتینومیست‏های هوازی هستند که یک گروه بزرگ از باکتری‏های ساکن خاک را شامل می‏شوند، که در جهان پخش شده‏اند. در این مطالعه، با استفاده از آزمون‏های تشخیصی رایج، مرسوم و مولکولی گوناگون، چندین ایزوله‏های نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد. مواد و روش‏‏ها: در این پژوهش، برای جداسازی از خاک، روش slip-buried و برای استخراج dna، روش microwave oven استفاده شد و در این روش‏ها، سویه...

full text

تنوع ژنتیکی باکتریهای گره زای ریشه یونجه در استان خراسان بر اساس توالی ژن .16s rrna

چکیده: یونجه یکی از گیاهان لگوم است که میزان زیادی علوفه تولید می کند. اغلب گونه های یونجه توانایی قابل توجهی در تثبیت نیتروژن دارند و کیفیت مراتع را در علفزارهای طبیعی و کشت شده بهبود می بخشد. باکتریهای خوانواده ریزوبیاسه قادر به تثبیت اتمسفر در ریشه گیاهان لگومینوزی همچون یونجه هستند. اهداف این تحقیق تعیین تنوع ژنتیکی میان استرین های باکتری گره زای یونجه در نمونه های جدا شده از خاک استان خراس...

15 صفحه اول

بررسی ساختار جمعیتی خیار دریایی holothuria parva با استفاده از توالی یابی ژن ریبوزومال میتوکندری (۱۶s rrna) در سواحل شمالی خلیج فارس

به منظور بررسی ساختار جمعیتی خیار دریایی گونه holothuria parva در دو منطقه بندر بستانه و بندر دیر، از روش توالی یابی ژن 16s rrna استفاده گردید. در مجموع 417 جایگاه نوکلئوتیدی بررسی شد که پس از بررسی در پایگاه داده ای ncbi، توالی ها با ژن 16s rrna همخوانی داشتند و تعلق نمونه ها به گونه h. parva تایید شد. در مجموع در دو منطقه 4 هاپلوتایپ شناسایی شد که یکی از هاپلوتایپ ها در دو منطقه مشترک بود. بن...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
علوم و فنون دریایی

جلد ۱۴، شماره ۳، صفحات ۱۴-۲۲

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023